フコイダンの生理作用は、インターロイキン12（IL－12）とインターフェロンガンマー（IFN－γ）の産生を誘導します。
ガゴメコンブから抽出した、U－フコイダン、F－フコイダン、G－フコイダンが、IL－12とIFN－γ産生を著しく増強することが認められました。
この作用は、ヒバマタのフコイダンにも認められましたが、沖縄モズクやワカメ芽株由来のフコイダンでは作用が弱く、日本海モズク由来のフコイダンでは作用がありませんでした。
フコイダン原料の海藻の種類や採取される地域の違いによって、フコイダンの働きや効能が異なると言われていますが、このことを証明する結果が出たことになります。
これはフコイダンの化学構造上の違いと考えられています。
